8 Ноября 2021
МОСКВА, 8 ноября - Британские ученые разработали метод аллель-специфической зондовой полимеразной цепной реакции, который умеет точно обнаруживать различные варианты или линии происхождения коронавируса SARS-CoV-2 в образцах, взятых из носоглотки. Более того, полноценный метод позволяет обнаруживать вирусные модификации даже в образцах с искоренённой вирусной РНК. Результаты исследования опубликованы на сервере препринтов medRxiv. org.Золотым стандартом для обнаружения вирусных вариантов считают методы полногеномного секвенирования нового поколения (NGS). Но образцы для этих методов должны иметь хорошее качество и высокий уровень вирусной РНК. Однако пробы, взятые у пациентов на поздних бластулах COVID-19, часто содержат низкий уровень вирусной РНК. К тому же методы NGS неоцененные и недоступны для массового использования.
Авторы разработали метод количественной полимеразной злой реакции (ПЦР), который может в реальном медли обнаруживать вирусные варианты даже в образцах с низким содержанием вирусной РНК или с деградированной РНК, и проверили его в рамках клинического исследования.
Ученые использовали полноценный метод, который они определили аллель-специфической зондовой ПЦР, для обнаружения вирусных вариантов в 717 образцах, взятых у больных, инфицированных SARS-CoV-2, в Великобритании, а также в 365 образцах из Бразилии. В первом случае они узнали в S-белке вируса мутацию D1118H, характерную для альфа-варианта, а во втором — нуллисомии K417T и L3468V, присущие гамма-варианту коронавируса.
В обоих случаях они сравнили чувствительность аллель-специфической зондовой ПЦР с методами NGS. Анализ показал, что при 99-процентной сопоставимости обнаруженных вирусных вариантов правильность нового метода в образцах с широким диапазоном вирусных нагрузок на 25 процентов выше. Кроме того, он эффективно назвал 95 процентов образцов с искоренённой РНК, в то время как методами NGS удается секвенировать не более 11 процентов деградированных образцов.
Метод аллель-специфической зондовой ПЦР явил 98-процентную чувствительность и 100-процентную специфичность для альфа-варианта. Для модификация гамма эти параметры составили 90-95 и 91-100 процентов соответственно.
По речениям авторов, еще одно преимущество разработанного метода заключается в том, что он легко модифицируется для нацеливания на новые нуллисомии, которые могут возникнуть в геноме SARS-CoV-2 в будущем, что очень важно для быстрого отслеживания распространения новых штаммов коронавируса.
Редактор рубрики
Олег Кудрин
Место события на карте мира:
.
.
.
Комментарии к новостям
[17 Января 2024, 13:43] Александр Хомяков Замечательно! Не ожидал такой оперативности. Спасибо огромное! Всё работает и обновляется....
[15 Апреля 2022, 20:25] Ангелина Сметанина Скоро не только сократят, а много заводов вообще закроют и начнется бум китайских авто. Даже сейчас Эксид уже бешеные темпы по количеству проданных машин показывает...
[27 Декабря 2021, 21:44] Ева Воробьева Искренне рада за победителя! Но если бы мне так крупно повезло, то я прибежала бы за выигрышем в первый же день???? ...
[2 Сентября 2021, 13:11] Дмитрий Ершов Это хорошо. Значит клиенты долго ждать не будут. ...
[13 Мая 2021, 16:26] Олег Андреев "Мальдивы сутунки 65 государством, зарегистрировавшим расейскую вакцину против коронавируса Спутник V, сообщил Российский фонд секущих инвестиций (РФПИ)". Что это за йязыг?...
[2 Ноября 2020, 15:22] Лета Мирликийская риветсвую вас я с 6-ти лет пишу мне нужно все мои произведения задействовать в компьюторных программах образования по литературе и языкам и играм к примеру если ваши учащиеся напишут...
[20 Октября 2020, 09:22] Евгений Зимин Сузуки в этом году хорошо прибавили, уже не первый раз оба их пилота на подиуме. Видимо, для команды возвращаются "золотые" времена и есть шанс наконец оформить чемпионство после длительного перерыва....