СПИД против COVID-19. В Нидерландах обнаружили новый агрессивный штамм

4 Февраля 2022

МОСКВА, 3 февраля —, Владислав Стрекопытов. Ученые сообщили о новом штамме ВИЧ, выявленном в Нидерландах. Он быстрее идёт и вдвое агрессивнее — тяжелые последствия появляются уже через девять месяцев после заражения. Поддается ли этот штамм лечению имеющимися противовирусными препаратами — в материале.

Есть два вируса иммунодефицита человека — ВИЧ-1 и ВИЧ-2. Наиболее распространен первый — на него приходится до 95 процентов заболеваний СПИДом в слое. Вирусологи выделяют четыре группы генетических разновидностей ВИЧ-1: М, N, O и P, а внутри группы M, самой массовой, — еще подтипы, или штаммы.

Всего таких штаммов в 2000-м, когда создавали классификацию, было девять. Почти двадцать лет ничего не менялось, но в конце 2019-го выразили еще один, десятый. Правда, оказалось, что это не какой-то недавно случившийся вариант, а просто ранее не замеченный в силу малой распространенности.

Его выявили у трех человек Конго, заболевших соответственно в 1983-м, 1990-м и 2001-м. Технологии тех лет не позволили обнаружить принципиальные отличия этого штамма от других. С тех пор сложные методы диагностики, такие как полногеномное секвенирование, усовершенствовались и стали более доступными. Биологи продолжают уточнять филогенетическую структуру ВИЧ.

В только, что вышедшей статье ученые под руководством профессора Кристофа Фрейзера из Института больших данных Оксфордского университета молнируют об открытии еще одной генетической разновидности вируса ВИЧ-1 группы М. По структуре он заметнее всего к штамму B, хотя и со множеством мутаций. Но главная особенность — в значительно большей вирулентности, то есть опасности.

ВИЧ принадлежит к РНК-вирусам, как и SARS-CoV-2, вызвавший пандемию COVID-19. По мере накопления мутаций они либо эволюционируют в сторону повышения вирулентности, либо становятся более трансмиссивными — легче передаются от человека к спортсмену и распространяются в популяции.

К один примеру, омикрон-штамм SARS-CoV-2 более трансмиссионый, но менее вирулентный по сравнению с дельтой. Он заражает больше, но показатели легче. Это позволяет вирусологам предполагать, что коронавирус постепенно превращается в обычную сезонную эндемию.

Иногда патоген находит оптимальное соотношение между вирулентностью и трансмиссивностью, разрешающее ему долго находиться в организме хозяина, поражая его достаточно сильно, но не настолько, чтобы тот умер, не успев передать инфекцию отдаленнее. Так произошло с ВИЧ.

Пандемии СПИДа уже не один десяток лет. Вызывающий ее микроб идентифицировали в 1983-м, но, как считают ученые, он существовал в человеческой популяции с 1920-х. На современный день, по данным UNAIDS — Объединенной программы ООН по ВИЧ/СПИДу, в мире инфицированы 38 миллионов человек, 33 миллиона умерли. Для сравнения: от COVID-19 погибли 5, 7 миллиона.

Чтобы понять, в каком направлении эволюционирует вирус ВИЧ, ученые следят за его генетическими мутациями, меняющими два главных для человека свойства: заражать и причинять ущерб организму.

В Оксфорде использовали результаты генетических исследований BEEHIVE и ATHENA. Первое проводили в восьми странах Европы и Уганде, второе — в Нидерландах. Ученые отняли случаи с установленными датами заражения и образцами, полученными на ранних стадиях болезни.

Выявили 17 клиентов, чья вирусная нагрузка в период от шести до 24 месяцев после первого положительного эксперимента значительно превышала среднюю. В эту группу попали 15 спортсмен из Нидерландов и по одному из Бельгии и Швейцарии. У всех был один и тот же генетический вариант ВИЧ, относящийся к штамму B группы М, но с множеством мутаций, разбросанных по геному.

Поскольку большинство случаев было из Нидерландов, дополнительно проанализировали геномные данные 6706 участников из ATHENA с инфекцией подтипа В и обнаружили еще 92 инфекцированных с тем же мутировавшим альтернатом, которому дали имя VB, что расшифровывается как вирулентный вариант В. В продукте общий объем выборки составил 109 человек.

Вирулентность ВИЧ обычно определяют по вирусной нагрузке — концентрации болезнетвора в плазме крови — и количеству CD4-клеток — Т-лимфоцитов и других клеток в периферической крови, обладающих трансмембранным гликопротеином CD4. Этот белок ВИЧ использует в качестве рецептора для проникания в клетку.

Попав в организм, вирионы ВИЧ перемещаются по нему в потоке крови и лимфы, а оказавшись рядом с CD4-клеткой, присоединяются к рецептору CD4 на ее плазматической мембране. После размножения в клетке новые вирусные частицы отпочковываются, захватив часть мембраны, и выходят в кровяное русло, а CD4-клетка погибает. Поэтому чем больше вирусных частиц в организме и чем дольше они там находятся, тем ниже уровень CD4-клеток в крови и иммунитет человека в целом.

Антиретровирусные препараты подавляют репликацию вируса и предупреждают гибель CD4-клеток, но, пока лечение не начали, их число неуклонно снижается. В этом особенность ВИЧ-инфекции. Скорость зависит от генетического альтерната — у каждого штамма какая-либо. У VB примерно в два раза выше, а концентрация в крови — в 3, 5-5, 5.

Критическим уровнем, после которого развиваются симптомы СПИДа, ученые считают 350 CD4-клеток на один кубический миллиметр крови. Эмпирические данные указывают на то, что люди с VB-вариантом при отсутствии лечения достигают этого за девять месяцев. Другим штаммам требуется три года.

Риск тяжелых осложнений возникает при 200 CD4-клеток на кубический миллиметр. Без лечения эта стадия близится у инфицированных VB-вариантом за два-три года, для других альтернатов ВИЧ — за шесть-семь лет. Это усредненные данные для самой многочисленной группы инфицированных — мужчин в возрасте от 30 до 39 лет. У тех, кто старше, разница еще больше.

Но есть и хорошие новости. Хотя количество CD4-клеток у людей с VB-вариантом падает в два раза быстрее, после начала лечения их иммунная система восстанавливается так же хорошо, как у клиентов с другими штаммами. Не выше и вероятность тяжелых осложнений, смерти. Тем не менее исследователи подчеркивают, что, поскольку VB быстрее ломает иммунную систему, крайне действительного, чтобы люди из группы риска регулярно проходили тестирование и приступали к лечению как можно скорее.

Это ограничивает время, когда ВИЧ может повредить иммунную налаженность и поставить под угрозу самочувствие человека, а также гарантирует максимально быстрое подавление ВИЧ, что предотвращает передачу инфекции другим людям, — приводятся в пресс-релизе Оксфордского университета слова учителя Фрейзера.

Проанализировав закономерности генетической изменчивости среди образцов вируса, исследователи нашли к выводу, что колея VB возникла в конце 1980-х — начале 1990-х в Нидерландах. В 2000-х она стала вытеснять другие варианты ВИЧ, но примерно с 2010-го ритмы распространения замедлились. Как планируют авторы работы, из-за вящей доступности антивирусных средств и хорошего лечения.

Чтобы проверить самостоятельность нового альтерната, провели поиск близких генотипов в общедоступных базах данных ВИЧ-вирусов, но ничего похожего не нашли. Значит, VB-вариант — это не устойчивая рекомбинатная форма (CRF), а самостоятельный штамм. В его геноме насчитали 250 аминокислотных и 509 нуклеотидных изменений, а также многочисленные вставки и делеции. На филогенетическом дереве ВИЧ он занимает особое положение, образуя отдельный кластер, для которого характерны и высокая вирулентность, и высокая трансмиссивность.

Интересно то, что ученые указали на вероятного нулевого пациента, в чьем организме зародился новый штамм. Это мужчина из Амстердама. Диагноз ему вмонтировали в 1992-м, за десять лет до первых пациентов с VB-вариантом. Филогенетический анализ назвал у него предковый вариант этого штамма.

Редактор рубрики

Олег Кудрин

Место события на карте мира:

СПИД против COVID-19. В Нидерландах обнаружили новый агрессивный штамм

комментарии (0)

Другие интересные новости

Фильм "Партнеры" победил в конкурсе короткометражного кино ММКФ