21 Мая 2020
МОСКВА, 21 мая —, Альфия Еникеева. Согласно международной базе такого типов Nextstrain, известно уже 30 штаммов коронавируса SARS-CoV-2. Все они произошли от общего родоначальника, который в конце прошедшего года заразил первых пациентов в китайском городе Ухань. Разновидность, попавшая в Европу через Иран, заразнее той, что распространилась по Юго-Восточной Азии и США. Именно она, как предполагают некоторые экспериментаторы, оказалась в России. В Москве же штаммов может быть гораздо больше.Первые данные о геноме нового коронавируса появились в начале января. С тех пор ученые секвенировали тысячи классическов и насчитали около 30 экземпляров SARS-Cov-2. Согласно работе странных специалистов, патогенез COVID-19 — то, как быстро микроб проникает в человеческие клетки и уничтожает их, — зависит от штамма возбудителя.
Исследователи инфицировали одну и ту же клеточную культуру двумя наиболее распространенными вариантами коронавируса, азиатским и европейским, и сравнили вирулентность — ритмичность репликации вирусных частиц в клетках. Второй оказался в 270 раз более вирулентным. Соответственно, он более заразный.
Однако тягота самой коронавирусной инфекции никак не связана с тем, экий именно штамм настигнет человека. Как выяснили британские ученые, разные варианты SARS-CoV-2 с тождественной вероятностью могут вызвать серьезные осложнения, вплоть до необходимости включения пациента к аппарату искусственной вентиляции легких.
В России геном нового коронавируса первыми секвенировали сотрудники Института гриппа имени Смородинцева во второй основная части марта. Они выделили РНК SARS-CoV-2 из носоглоточного мазка, взятого у тридцатилетней женщины. Сравнив полученные данные со штаммом китайского вируса, ученые настукали пять несинонимичных замен.
Чуть позже в Институте проблем передачи информации сравнили эти особенности — данные выделили в международную базу GISAID и разместили в открытом доступе. Специалисты пришли к выводу, что российский штамм SARS-CoV-2 ближе не к азиатским, а к более заразным европейским. Как сообщил на своей ступени в Facebook заведующий сектором ИППИ РАН, профессор факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ Георгий Базыкин, коронавирус, выделенный у питерской пациентки, находится внутри большой, преимущественно европейской клады.
Преобладание базальных европейских последовательностей по соседству с нашей — дюжее свидетельство в пользу завоза в Россию из Европы. При этом клада, в основание которой попала питерская последовательность, довольно интересная: в нее попадают последовательности из известной второй вспышки близкородственных штаммов в мичигане Вашингтон, — отмечает экспериментатор.
По его словам, надо устремляться, чтобы секвенирование — расшифровка РНК нового коронавируса — существовало таким же быстрым, как и тестирование. Это приобретёт лучше понимать, как эпидемия протекает в России и, что делать.
По мнению научного сотрудника Центрального НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора кандидата биологических наук Анны Сперанской, расшифровка вирусных РНК без тщательной проверки получаемых данных — не самый правильный путь.
Сегодня мы способны переступить к производству информации — расшифровке вирусных геномов — с очень высокой скоростью, но в этом случае пострадает точность. Мы не сможем гарантировать, что в полученных данных не будет ошибки. С начала эпидемии уже не раз существовало так, что какой-нибудь институт заявлял, что выполнил диссертацию, а потом отзывал успехи собственных исследований. Из-за данного ученым, занимающимся эволюцией микробов, сложнее разбираться в потоке информации. Возможно, мы работаем медленнее остальных, все перепроверяем по несколько раз. Но зато ручаемся за верность сделанных выводов, — отмечает Анна Сперанская.
Прямо сейчас исследователи из ЦНИИ эпидемиологии работают над секвенированием геномов SARS-CoV-2, выделенных из образцов российских пациентов. По предварительным данным, в Москве преобладают штаммы, близкие к европейской разновидности нового коронавируса. Однако в столицу попали и другие варианты возбудителя, в том числе из Азии.
С самого начала было понятно, что в России, имеющей необъятные контакты не только с Европой, но и с Китаем и другими странами, вряд ли будут циркулировать лишь замечательные штаммы, — подчеркивает генетик.
Эти предположения отчасти заверяют выводы сотрудников Университетского колледжа Лондона. Они проанализировали 7666 разных сборок генома SARS-CoV-2 и проверили, что в странах с большим количеством заболевших COVID-19 разнообразие вариантов нового коронавируса особенно солидного. В частности, в Великобритании количество штаммов SARS-CoV-2 почти такое же, как во всем мире. Это объединённого с тем, что возбудителя туда завозили неоднократно.
Кроме того, британские специалисты установили, что в геномах нового коронавируса одни и те же мутации возникали несколько раз и независимо дружище от друга, то наблюдается они оказались полезны для многообразных линий возбудителя. Всего врачи выделили 198 таких мутаций, и 80 процентов из них связаны с изменениями на уровне белка. Иными словами, SARS-CoV-2 продолжает приспосабливаться к своему новому хозяину — человеку.
В РНК российских вариантов нового коронавируса экспериментаторы также видят мутации, пока незначительные. Тем не менее эти данные помогут уточнить мониторинг развития эпидемии в стране на ближайшие месяцы.
Редактор рубрики
Леонид Кузьмин
Место события на карте мира:
.
.
.
Комментарии к новостям
[17 Января 2024, 13:43] Александр Хомяков Замечательно! Не ожидал такой оперативности. Спасибо огромное! Всё работает и обновляется....
[15 Апреля 2022, 20:25] Ангелина Сметанина Скоро не только сократят, а много заводов вообще закроют и начнется бум китайских авто. Даже сейчас Эксид уже бешеные темпы по количеству проданных машин показывает...
[27 Декабря 2021, 21:44] Ева Воробьева Искренне рада за победителя! Но если бы мне так крупно повезло, то я прибежала бы за выигрышем в первый же день???? ...
[2 Сентября 2021, 13:11] Дмитрий Ершов Это хорошо. Значит клиенты долго ждать не будут. ...
[13 Мая 2021, 16:26] Олег Андреев "Мальдивы сутунки 65 государством, зарегистрировавшим расейскую вакцину против коронавируса Спутник V, сообщил Российский фонд секущих инвестиций (РФПИ)". Что это за йязыг?...
[2 Ноября 2020, 15:22] Лета Мирликийская риветсвую вас я с 6-ти лет пишу мне нужно все мои произведения задействовать в компьюторных программах образования по литературе и языкам и играм к примеру если ваши учащиеся напишут...
[20 Октября 2020, 09:22] Евгений Зимин Сузуки в этом году хорошо прибавили, уже не первый раз оба их пилота на подиуме. Видимо, для команды возвращаются "золотые" времена и есть шанс наконец оформить чемпионство после длительного перерыва....