12 Марта 2020
МОСКВА, 12 марта - Американские ученые разработали способ выявления рака на ранних стадиях по анализу крови на микробную ДНК. Это совершенно новый вид так прозываемой жидкой биопсии. Результаты нарисованным в журнале Nature.Обнаружение рака на самых ранних стадиях с помощью простого анализа крови является миссией нескольких компаний, разрабатывающих в настоящее время жидкие биопсии для выявления циркулирующей в организме ДНК опухоли человека.
Ученые из Калифорнийского института в Сан-Диего предложили использовать для этого не ДНК опухоли, а ДНК микробов — бактерий и вирусов, связанных с этой опухолью, что намного проще и информативнее.
Почти все прежние исследования рака предполагали, что опухоли являются стерильной средой, и игнорировали сложное взаимодействие человечьих раковых клеток с бактериями, вирусами и другими микробами, которые живут в наших туловищах и на них, — приводятся в пресс-релизе университета существительного руководителя исследования Роба Найта (Rob Knight), председателя Центра микробиомных инноваций Калифорнийского института в Сан-Диего. — Количество микробных генов в нашем организме значительно превосходит количество человеческих генов, поэтому не удивительно, что они дают нам существенные подсказки, касающиеся нашего здоровья.
Исследователи изучили данные секвенирования 18116 образцов микробной ДНК из Атласа генома рака — базы данных Национального института рака, содержащей геномную и другую информацию о тысячах пациентов с 33 различными разрядами рака. Это крупнейшее в мире хранилище данных по микробной ДНК раковых больных.
Ученые выявили микробные признаки, или паттерны, связанные с конкретными типами рачка. Некоторые из них побывальщины ожидаемыми, такие как уза между вирусом папилломы человека и раком шейки матки, руководителя и шеи, а также связь между видами Fusobacterium и раком желудочно-кишечного тракта. Но были идентифицированы и новые связи — так называемые микробные копии. Например, наличие импозантов Faecalibacterium указывало на рак басистой кишки и отличало его от других видов рака.
Имея в своем распоряжении микробиомы тысяч образцов рачка, ученые с помощью методов машинного обучения создали систему идентификации определенных видов рака по микробным паттернам. В итоге, модели машинного обучения смогли точно определять тип рака пациента по микробным данным его крови. Причем многие типы рака хорошо диагностировались на ранних стадиях.
Затем авторы протестировали свой метод на образцах плазмы крови реальных пациентов — свои данные предоставили для исследования 59 пациентов с рачком простаты, 25 — с раком легких и 16 — с меланомой, —, а также сравнили их с образцами плазмы 69 здоровых людей.
Модели машинного обучения определили людей без нездоровий в 100 процентах случаев, чувствительность метода для рака легких составила 86 процентов, в 81 проценте случаев модели смогли отличить рак простаты от рачка легких.
Ученые считают, что наибольшей эффективности при диагностике можно добиться при совмещении методов жидкой биопсии по ДНК опухоли и микробной ДНК.
Возможность получить из одной колбы крови полный профиль ДНК саркомы, а также ДНК микробиоты пациента является важным шагом вперед в понимании взаимодействия опухоли и ее окружения, что дает потенциал для мониторинга изменений с течением времени. Это быть может иметь серьезные последствия для ухода за больными раком и для раннего выявления рака, — говорит еще один автор исследования Сандип Правин Патель (Sandip Pravin Patel), профессор медицинских наук, медицинский онколог и один из руководителей исследовательской терапии в Онкологическом центре Калифорнийского университете в Сан-Диего.
Исследователи предполагают, что дальнейшее исследование микробной ДНК, связанной с раком, может открыть новое направление в разработке лечения онкологических заболеваний.
Редактор рубрики
Олег Кудрин
Место события на карте мира:
.
.
.
Комментарии к новостям
[17 Января 2024, 13:43] Александр Хомяков Замечательно! Не ожидал такой оперативности. Спасибо огромное! Всё работает и обновляется....
[15 Апреля 2022, 20:25] Ангелина Сметанина Скоро не только сократят, а много заводов вообще закроют и начнется бум китайских авто. Даже сейчас Эксид уже бешеные темпы по количеству проданных машин показывает...
[27 Декабря 2021, 21:44] Ева Воробьева Искренне рада за победителя! Но если бы мне так крупно повезло, то я прибежала бы за выигрышем в первый же день???? ...
[2 Сентября 2021, 13:11] Дмитрий Ершов Это хорошо. Значит клиенты долго ждать не будут. ...
[13 Мая 2021, 16:26] Олег Андреев "Мальдивы сутунки 65 государством, зарегистрировавшим расейскую вакцину против коронавируса Спутник V, сообщил Российский фонд секущих инвестиций (РФПИ)". Что это за йязыг?...
[2 Ноября 2020, 15:22] Лета Мирликийская риветсвую вас я с 6-ти лет пишу мне нужно все мои произведения задействовать в компьюторных программах образования по литературе и языкам и играм к примеру если ваши учащиеся напишут...
[20 Октября 2020, 09:22] Евгений Зимин Сузуки в этом году хорошо прибавили, уже не первый раз оба их пилота на подиуме. Видимо, для команды возвращаются "золотые" времена и есть шанс наконец оформить чемпионство после длительного перерыва....