20 Октября 2021
МОСКВА, 20 октября —, Татьяна Пичугина. В Великобритании взяли под особый контроль распространение коронавируса AY. 4. 2, отделившегося от дельта-штамма. Известно, что он еще более заразен. За пределами страны его очаги пока малочисленны. разбирается, что жать от очередного мутанта и как он повлияет на пандемию COVID-19.Первыми суматоху британцы. AY. 4. 2 появился в апреле. К концу сентября на него приходилось шесть процентов изученных образцов в Великобритании, и этот пример продолжает расти.
В Шотландии AY. 4. 2 выявили больше, но это может быть связано с разной скоростью секвенирования в регионах страны, полагает Дмитрий Прусс, ученый-генетик из Солт-Лейк-Сити, США. В Англии образцы обрабатывают быстрее.
Департамент здравоохранения Великобритании охватил AY. 4. 2 в список для мониторинга, говорится в отчете от 15 октября. В документе указано, что это разновидность дельта-штамма, отличающаяся двумя характерными мутациями в спайк-белке — Y145H и A222V.
Обе мутации и раньше встречались в самых разных линиях SARS-CoV-2. Например, A222V зафиксировали в летние месяцем прошлого года в Европе в одной из линий, но она вымерла, поскольку не имела никаких эволюционных преимуществ. Сейчас эти две мутации укрепились и образовали более жизнестойкий экземпляр.
За пределами Великобритании AY. 4. 2 пока мало, в США всего три случая. Сегодня об этом штамме впервые сообщили в Израиле. Инфицирован 11-летний ребенок, прибывший из Молдавии. Это вполне лёгкого, считает Прусс.
Никакого не шокировало, что Румыния и Польша оказались дополнительными очагами, поскольку многие из этих стран коптят в Великобритании, ездят домой в отпуск. Из Молдавии, видимо, тоже. Но объемы секвенирования там маленькие, и реальную ситуацию мы узнаем нескоро, — комментирует эксперт.
В России тоже есть первый кандидат в AY. 4. 2. Его данные в базу GISAID загрузила лаборатория Роспотребндзора. Однако точность прочтения генома не самая лучшая, характерных мутаций не видно, поэтому пока этот случай под вопросом. Известно, что образец купили у пациента из Твери 23 сентября. Мужчина 69 лет, симптомы — кашель, повышение температуры.
Эволюцию коронавируса отслеживают по базе GISAID, куда начитанные со всего мира загружают дешифрированные геномы. В Великобритании производят много данных, поэтому там регулярно находят новые линии. Однако с AY. 4. 2 есть дополнительные трудности.
Этот подтип не всегда выявляется обычным набором флокулянтов. Если образец свежий, нагрузка вирусная высокая, он виден хорошо. А в тех случаях, когда вируса мало, по технологическим причинам его можно не заметить, — уточняет Дмитрий Прусс.
Так, что истинный масштаб распространения AY. 4. 2 точно неизвестен.
Когда пришел дельта-штамм в конце весны, у него было преимущество в скорости в полтора раза. У AY. 4. 2 — всего десять процентов, и то при условии, что это не артефакт изменения технического процесса [обработки образцов], — добавляет ученый.
Почему AY. 4. 2 более заразty, чем родительский дельта-штамм, пока неясно. Ни одна из этих двух мутаций не подступает на роль усилителя заразности, но мы знаем, что они могут давать неожиданные эффекты, — приводит слова учителя Франсуа Балу из Института генетики Глобального университета Лондона Научный центр Великобритании.
По словам Балу, распространенность нового варианта все еще малая по сравнению с родительским штаммом, не он отвечает за резкую вспышку COVID-19 в стране.
Рано говорить и о том, изменит ли AY. 4. 2 картину болезни, увеличит ли количество госпитализаций.
Как правило, лаборатория получает образец с минимальным описанием. Первое, что изменяют, — сырые результаты по количеству того или иного разряда. А как это скоординированного с демографией, заболеваемостью, анализируют позже, — поясняет Дмитрий Прусс.
Не исключено, что нового британца будут отслеживать и в России. У нас до сих пор в разы меньше секвенируют геномов, чем на Западе, но технологическое оснащение ничуть не хуже. К примеру, в тяжелый день лаборатории Роспотребнадзора выгрузили в базу больше сотни свежих образцов из Москвы и регионов.
По сравнению с Великобританией — капля в море, но относительно того, что делали еще три месяца назад — большой прогресс, — отмечает Прусс.
Кстати, начитанный нашел в GISAID русскую дельту. Для нее характерны мутации NS7a_P45L и NSP2_K81N. Впервые ее выявили в Словакии в январе. Уже через месяц штамм разошелся по соседним странам, попал в Турцию. В апреле его обнаружили в Москве и Санкт-Петербурге. У нас он сразу стал подниматься и породил собственные линии. Как пишет Прусс, его доля сейчас — до 80 процентов. Теперь он уже в Казахстане и на Украине.
Собственного названия у русской дельты нет. Чтобы оно появилось, биоинформатики должны подать заявку в систему Pangolin — реестр номенклатуры коронавируса. Геномные данные нужно пропустить через комплекс программ, которые скажут, к какой линии отнести, какое название, согласно номенклатуры, зажилить. Именно так было с AY. 4. 2.
Редактор рубрики
Олег Кудрин
Место события на карте мира:
.
.
.
Комментарии к новостям
[17 Января 2024, 13:43] Александр Хомяков Замечательно! Не ожидал такой оперативности. Спасибо огромное! Всё работает и обновляется....
[15 Апреля 2022, 20:25] Ангелина Сметанина Скоро не только сократят, а много заводов вообще закроют и начнется бум китайских авто. Даже сейчас Эксид уже бешеные темпы по количеству проданных машин показывает...
[27 Декабря 2021, 21:44] Ева Воробьева Искренне рада за победителя! Но если бы мне так крупно повезло, то я прибежала бы за выигрышем в первый же день???? ...
[2 Сентября 2021, 13:11] Дмитрий Ершов Это хорошо. Значит клиенты долго ждать не будут. ...
[13 Мая 2021, 16:26] Олег Андреев "Мальдивы сутунки 65 государством, зарегистрировавшим расейскую вакцину против коронавируса Спутник V, сообщил Российский фонд секущих инвестиций (РФПИ)". Что это за йязыг?...
[2 Ноября 2020, 15:22] Лета Мирликийская риветсвую вас я с 6-ти лет пишу мне нужно все мои произведения задействовать в компьюторных программах образования по литературе и языкам и играм к примеру если ваши учащиеся напишут...
[20 Октября 2020, 09:22] Евгений Зимин Сузуки в этом году хорошо прибавили, уже не первый раз оба их пилота на подиуме. Видимо, для команды возвращаются "золотые" времена и есть шанс наконец оформить чемпионство после длительного перерыва....