15 Июня 2020
МОСКВА, 15 июня - Ученые из МФТИ совместно с российскими коллегами из других институтов и делающими медиками впервые успешно применили схем РНК-секвенирования для диагностики рака. Результаты исследования опубликованы в журнале Biomedicines.Классический метод диагностики онкологических заболеваний — иммуногистохимическое окрашивание срезов опухолевой ткани. Этот метод дозволяет выявить наличие и измерить количество белков-маркеров, характерных для худых новообразований.
Для проведения процедуры иммуногистохимического окрашивания образец опухоли погружают в горячий парафин. После остывания блок парафинизованной ткани нарезают на тонкие срезы, которые окрашивают и исследуют под микроскопом. Результаты позволяют судить о молекулярном виду опухоли и ее злокачественности, что крайне важно для сортировка подходящей терапии.
Авторы работы предложили для онкодиагностики метод РНК-секвенирования как альтернативу и дополнение к классическому схему иммуногистохимии. При этом в качестве исходного материала они использовали те же парафинизованные фрагменты подтеки, что позволило избежать дополнительного взятия биопсии у пациента, а также комбинировать результаты обоих методов. Работа была исполненная при поддержке Российского научного фонда (РНФ).
Принцип метода РНК-секвенирования состоит в определении последовательностей и количеств всех молекул РНК, присутствующих в клетке. Полученная совокупность данных, так величаемый транскриптом, содержит информацию об уровне активности всех генов в клетке. Для анализа таких больших объемов данных биоинформатики одевают специализированные алгоритмы, создают базы данных транскриптомов различных клеток и тканей человека.
Мы впервые представили, что результаты этих двух методик прекрасно соответствуют друг благоприятелю, только для иммуногистохимических исследований нужно сделать намного больше экспериментов — столько, сколько биомаркеров нужно посмотреть, — и потратить гораздо больше материала. А РНК-секвенирование позволяет сразу количественно охарактеризовать работу всех белок-кодирующих генов, а их около 20 тысяч! — приводятся в пресс-релизе РНФ слова руководителя исследования Антона Буздина, заведующего лабораторией трансляционной геномной биоинформатики МФТИ.
В своем исследовании авторы для нескольких типов опухолей показали наличие четкой взаимообусловленности между уровнем экспрессии четырех разных генов-маркеров опухоли, измеренных методом РНК-секвенирования, и результатами иммуногистохимического окрашивания.
Мы уверены, что у РНК-секвенирования большое будущее в медицинской диагностике, и очень счастливым, что наша работа, как мы надеемся, хоть немного смогла его приблизить, — говорит Антон Буздин.
В исследовании, кроме ученых из МФТИ, приняли участие их коллеги и медики из Института персонализированной медицины Первого Московского народного медицинского университета имени И. М. Сеченова, Института биоорганической химии имени М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова, Карельского республиканского онкологического диспансера, медцентра ВитаМед, МГУ имени М. В. Ломоносова, Калужской областной онкологической больницы, Онкологического диспансера Республики Карелия.
Редактор рубрики
Олег Кудрин
Место события на карте мира:
.
.
.
Комментарии к новостям
[17 Января 2024, 13:43] Александр Хомяков Замечательно! Не ожидал такой оперативности. Спасибо огромное! Всё работает и обновляется....
[15 Апреля 2022, 20:25] Ангелина Сметанина Скоро не только сократят, а много заводов вообще закроют и начнется бум китайских авто. Даже сейчас Эксид уже бешеные темпы по количеству проданных машин показывает...
[27 Декабря 2021, 21:44] Ева Воробьева Искренне рада за победителя! Но если бы мне так крупно повезло, то я прибежала бы за выигрышем в первый же день???? ...
[2 Сентября 2021, 13:11] Дмитрий Ершов Это хорошо. Значит клиенты долго ждать не будут. ...
[13 Мая 2021, 16:26] Олег Андреев "Мальдивы сутунки 65 государством, зарегистрировавшим расейскую вакцину против коронавируса Спутник V, сообщил Российский фонд секущих инвестиций (РФПИ)". Что это за йязыг?...
[2 Ноября 2020, 15:22] Лета Мирликийская риветсвую вас я с 6-ти лет пишу мне нужно все мои произведения задействовать в компьюторных программах образования по литературе и языкам и играм к примеру если ваши учащиеся напишут...
[20 Октября 2020, 09:22] Евгений Зимин Сузуки в этом году хорошо прибавили, уже не первый раз оба их пилота на подиуме. Видимо, для команды возвращаются "золотые" времена и есть шанс наконец оформить чемпионство после длительного перерыва....