29 Июля 2020
МОСКВА, 29 июля - Международный синдикат ENCODE, состоящий из 500 ученых-биологов из многих стран круга сообщил о завершении третьего шага глобального проекта по составлению энциклопедии функциональных элементов ДНК. В 14 статьях, опубликованных в журналах Nature, Nature Methods и Nature Communications, писатели подводят итоги 17-летней работы.Геном каждый человека содержит около 20 тысяч генов, кодирующих белки, на долю которых приходится всего около 1, 5 процентов ДНК генома человека.
Международный исследовательский консорциум ENCODE, созданный в 2003 году и задуманный как продолжение проекта Геном человека, ставит целью собирание всеобъемлющего каталога функциональных элементов генома человека и мыши, охватываю кодирующие белки гены, некодирующие гены и регуляторные элементы.
Все результаты, получаемые в подкопе реализации проекта, публикуются в открытых базах данных. Тысячи исследователей во всем мире уже воспользовались данными ENCODE для определения генетических изменений, влияющих на появление таких болезней, как рак, сердечно-сосудистые заболевания и многие другие.
Когда был завершен первый набросок генома человека, сразу стало ясно, что первичная последовательность генома — это черновик, — приводятся в пресс-релизе Лаборатории в Колд-Спринг-Харбор слова одного из участников консорциума, знатока лаборатории Томаса Джингераса (Thomas Gingeras). — Мы знали, где находятся гены, но знаний о том, где расположены регуляторные механизмы и локусы, было недостаточно.
В ходе третьей фазы проекта проверщики провели почти шесть тысяч самый актуальных экспериментов — 4834 с непосредственное участием человеческих образцов и 1158 — на мышах — и присовокупили в онлайн-реестр более 1 200 000 функциональных элементов — областей некодирующей ДНК, которые направляют транскрипцию генов, охватывающих 7, 9 процента человеческого генома и 3, 4 процента генома мыши.
Часть исследований посвящена изучению принципов, регулирующих работу некоторых из этих функциональных элементов.
Например, Майкл Снайдер (Michael Snyder) из Медицинской школы Стенфордского университета в США и его коллеги исследовали взаимодействие хроматина — комплекса ДНК и белков — в 24 типах клеток человека и обнаружили, что различия в цикличности хроматина между типами клеток могут влиять на экспрессию генов.
Команда Томаса Джингераса изучила элементы генома, которые инструктируют клетки о том, как и в тех случаях, когда транскрибировать последовательности ДНК в РНК. Ученым удалось идентифицировать и описать молекулярные признаки пяти групп клеток человека.
Наша работа определяет, основываясь на экспрессии генов, основные гистологические типы, по которым традиционно классифицируются ткани человека, — говорит Родерик Гиго (Roderic Guigó) из Центра геномного регулирования, один из авторов исследования.
Участники консорциума отмечают, что элементы, памм брокеры функционированием генов, целиком шифруются в геноме человека и знания об их организации могут послужить отправной точкой для изучения нарушений развития человека. Однако, несмотря на очевидный прогресс, многие элементы, которые воздействуют на конкретные типы или богатства генов, еще предстоит диагностировать.
Эта энциклопедия является живым ресурсом. У нее есть начало, но на самом деле нет конца. Со временем она будет только совершенствоваться и расти, — пишут во интродукционной статье авторы.
На четвертом этапе исследования участники проекта ENCODE планируют сосредоточить усилия на новых типах анализируемых клеток и тканей.
Редактор рубрики
Олег Кудрин
Место события на карте мира:
.
.
.
Комментарии к новостям
[17 Января 2024, 13:43] Александр Хомяков Замечательно! Не ожидал такой оперативности. Спасибо огромное! Всё работает и обновляется....
[15 Апреля 2022, 20:25] Ангелина Сметанина Скоро не только сократят, а много заводов вообще закроют и начнется бум китайских авто. Даже сейчас Эксид уже бешеные темпы по количеству проданных машин показывает...
[27 Декабря 2021, 21:44] Ева Воробьева Искренне рада за победителя! Но если бы мне так крупно повезло, то я прибежала бы за выигрышем в первый же день???? ...
[2 Сентября 2021, 13:11] Дмитрий Ершов Это хорошо. Значит клиенты долго ждать не будут. ...
[13 Мая 2021, 16:26] Олег Андреев "Мальдивы сутунки 65 государством, зарегистрировавшим расейскую вакцину против коронавируса Спутник V, сообщил Российский фонд секущих инвестиций (РФПИ)". Что это за йязыг?...
[2 Ноября 2020, 15:22] Лета Мирликийская риветсвую вас я с 6-ти лет пишу мне нужно все мои произведения задействовать в компьюторных программах образования по литературе и языкам и играм к примеру если ваши учащиеся напишут...
[20 Октября 2020, 09:22] Евгений Зимин Сузуки в этом году хорошо прибавили, уже не первый раз оба их пилота на подиуме. Видимо, для команды возвращаются "золотые" времена и есть шанс наконец оформить чемпионство после длительного перерыва....