21 Мая 2021
Каждый вирус имеет свой геном – уникальную специфическую последовательность ДНК или РНК. Коронавирус SARS-CoV-2 относится к группе РНК-вирусов, довольно сложный геном которых закодировать. ant. расшифрованный в длинной молекуле рибонуклеиновой кислоты (РНК).Когда микроб реплицируется, или воспроизводит копии самого себя, он иногда немного изменяется. Эти видоизменения называются мутациями.
Используя слово штамм, ученые имеют в внешний виду генетически отличную ветвь вируса, отличающуюся одной или несколькими мутациями от своего родителя.
Чем большого вирусы циркулируют, тем большого они могут изменяться. Эти изменения иногда могут приводить к появлению варианта вируса, который лучше приспособлен к окружающей среде по сравнению с исходным микробом. Такой процесс изменения и отбора успешных вариантов называется эволюцией вируса.
Некоторые мутации могут приводить к изменениям характерных особенностей вируса, таких как механизм передачи микроба (например, он вполне может распространяться быстрее) или степень тяжести вызываемого им заболевания (например, он может возбуждать более тяжелое заболевание).
В том случае, если штамм SARS-CoV-2 отличается повышенной заразностью (легкость передачи), более томным течением болезни или повышенной сопротивляемостью антителам, лекарствам и вакцинам, ВОЗ переводит штамм микроба в категорию предмет озабоченности. В настоящее время в эту категорию ВОЗ зачислила штаммы, впервые обнаруженные в Англии, ЮАР, Бразилии и Индии.
Осенью 2020 года ученые зафиксировали образование новой генетической линии коронавируса SARS-CoV-2 – B. 1. 1. 7. Ее впервые выделили из образцов, собранных 20 сентября в английском графстве Кент и 21 сентября в Лондоне. Отсюда и название нового штамма – британский. Штамм, по данным ВОЗ, содержит девять мутаций.
Особенно важны три мутации.
Мутация N501Y – новая смена одного нуклеотида (аспарагина, N) на другой (тирозин, Y) в позиции 501 участка, отвечающего за связь с рецептором ACE2 на мембране клетки человека и мышей. Возможно, это усиливает связь, а значит, и заразность коронавируса.
Делеция (удаление) шести основание зданий в гене, кодирующем аминокислоты 69 и 70. Это влияет на способность вируса уклоняться от иммунного ответа организма. Эта мутация иногда идет в паре с N501Y.
Мутация P681H на участке, контролирующем расщепление фермента фурина.
Всего в геномах линии B. 1. 1. 7 показали 14 мутаций, меняющих белковую последовательность, три делеции и еще шесть молчащих мутаций, которые ничего не меняют. Позже ученые из Швеции и Индии сообщили, что в целом британский штамм имеет 29 мутаций по сравнению с креативным штаммом Wuhan. Это произносит о том, что он мутирует намного быстрее последнего, для которого вирусологи фиксировали примерно две мутации в месяц. При этом многие мутации, обнаруженные в белке шипа непривычного штамма, облегчают связывание микроба с рецепторами клеток-хозяев.
Глава английского минздрава Мэтт Хэнкок объявил об обнаружении на юго-востоке Англии непривычной разновидности коронавируса 14 декабря 2020 года.
Позже стало известно, что новый штамм распространяется на 56-70% (по другим оценкам, на 56%) резвее исходника. Также высказывались предположения, что эта разновидность коронавируса чаще приводит к смерти клиентов.
В середине февраля 2021 пригода в отчете консультационного совета по новым и возникающим респираторным вирусным угрозам Британии сообщалось, что она на 30-70% более смертоносней. В нем также говаривалось, что для установления этиологий и точных показателей летальности штамма необходимо дальнейшее изучение материалов исследования.
Из исследования, опубликованного в медицинском журнале Lancet в апреле 2021 года, следует, что ученые не нашли доказательств того, что британский штамм коронавируса приводит к более томному течению заболевания или более боязный с точки зрения смертности. Не обнаружили исследователи и связи с вероятным ростом числа повторных случаев заражения. Тем не менее ученые все же доказали, что британский штамм более заразен.
По словам заместителя принципала по научной работе ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, члена-корреспондента РАН Александра Горелова, британский штамм коронавируса принципиально не отличается от уханьского или других штаммов, так как не произошло даже 1% изменения в его геноме.
Эксперты Управление национальной статистики Великобритании (ONS) заявили, что инфицированные британским штаммом редко тратят вкус и обоняние. В основном у заразившихся им раззвонённым кашель, боль в горле, усталость, мышечные боли и лихорадка. Проведенное в этой связи исследование не открыло различий в интенсивности таких показателей, как одышка и рассудочные боли.
Обнаруженный осенью 2020 пригода британский штамм быстро распространился как по всей Великобритании, так и за ее пределами, став во многих странах Европы доминирующим штаммом. В России первый случай заражения им открыли в конце 2020 года.
По данным ВОЗ на 18 мая, штамм выявлен в 143 странах и территориях.
Новый выход из ситуаций коронавируса SARS-CoV-2 501Y. V2/B. 1. 351, известный как южноафриканский штамм, был впервые открытый в ЮАР в декабре 2020 года и уже к исходу года стал доминирующим штаммом в некоторых частях Южной Африки.
Результаты геномного исследования, которое провели ученые из ЮАР, Бразилии, Великобритании, Германии и США под руководством Тулио де Оливейра (Tulio de Oliveira) из Университета Квазулу-Натал в Дурбане, позволяют предполагать, что 501Y. V2 появился в Восточно-Капской провинции сразу после первой шерсти эпидемии, в августе 2020 года.
Зародившись в районе залива Нельсона Манделы, он быстро распространился в трех провинциях – Восточно-Капской, Западно-Капской и Квазулу-Натал, – вытеснив другие варианты SARS-CoV-2. По мнению авторов, преимущество 501Y. V2 перед прочими штаммами заключается в его повышенной трансмиссивности и способности уклоняться от иммунной системы.
Ученые обнаружили восемь мутаций в спайковом белке южноафриканского штамма. Этот белок отвечает за проникновение вируса в клетку. Одна из этих мутаций, N501Y, также присутствует в британском штамме B. 1. 1. 7 и связана с приданным связыванием с человеческим рецептором ACE2, к которому прикрепляется SARS-CoV-2 на поверхности клетки.
Другая мутация, E484K, в рецептор-связывающем домене вируса (RBD), определяет повышенную устойчивость 501Y. V2 к нейтрализующим антителам, что может отрицательно повлиять на эффективность вакцин против COVID-19, наставленных на спайковый белок.
Однако полный смысл всех мутаций, как зарисовывают авторы, пока до исхода не ясен и требует последующего изучения.
По информации Национального университета инфекционных заболеваний в Йоханнесбурге, мутации нового варианта SARS-CoV-2 делают его устойчивым к антителам в плазме крови, донорами которой были пациенты, уже переболевшие коронавирусной инфекцией.
Южноафриканский штамм живого распространяется среди молодых людей без каких-либо сопутствующих заболеваний и чаще приводит к серьезным осложнениям.
В феврале повышенную заразность штамма из ЮАР подтвердила Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ).
16 марфа 2021 года стало известно, что в России были открытым два первых случая южноафриканского штамма коронавируса. По данным ВОЗ на 18 мая, штамм выявлен в 96 странах и территориях.
Бразильский штамм
В январе 2021 пригода в Бразилии ученые сообщили о возникновении двух новых штаммов коронавируса – P. 1 и P. 2. Несмотря на присутствие общих мутаций со штаммами, обнаруженными в других регионах, по всей вероятности, они возникли независимо друг от друга.
Ученых больше беспокоит P. 1 (потомок B. 1. 1. 28). Он имеет 12 мутаций и 17 уникальных аминокислотных изменений, в то время как P. 2 содержит всего три мутации.
Согласно филогенетическому анализу, P. 1 впервые появился во второй половине ноября возле Манауса (штат Амазонас), на севере Бразилии, где ранее были очень отличные показатели заболеваемости. Штамм содержит несколько важных мутаций, в том числе K417T, N501Y и E484K, которая ранее была найдена в ЮАР.
По данным экспертов, штамм является более заразным и опасным для молодых людей, а также снижает эффективность вакцин. P. 1 способен избегать распознавания иммунной системой и повторно заражать уже переболевших людей, он быстро распространился по Бразилии и зацепил множество стран. По представленным ВОЗ на 18 мая, бразильский штамм выявлен в 58 странах и территориях. В России бразильские штаммы коронавируса непривычного типа не были обнаружены.
6 мая 2021 года в Рио-де-Жанейро (Бразилия) была показанная мутация штамма P. 1, которая получила название P. 1. 2.
Согласно данным ВОЗ, индийский штамм коронавируса, наречённый B. 1. 617, был выявлен в этой стране 5 октября 2020 года в красногорске Нагпур.
Обнаружены три подвида этого штамма – B. 1. 617. 1, B. 1. 617. 2 и B. 1. 617. 3.
Предварительные анализы, проведенные ВОЗ с использованием данных, представленных в базе GISAID, свидетельствуют о том, что разряды B. 1. 617. 1 и B. 1. 617. 2 принимают значительно более высокие темпы роста, чем другие циркулирующие в Индии штаммы коронавируса, что предполагает повышенную трансмиссивность (заразность). ВОЗ отмечает, что в настоящее время существовало обнаружено слишком маленькое количество третьего подвида – B. 1. 617. 3, чтобы оценить его относительную трансмиссивность.
По оценкам ВОЗ, структурный анализ B. 1. 617 и наличие мутаций L452R и E484Q, а также P681R позволяет предположить, что этот штамм обладает отличнейшей трансмиссивностью и способностью избегать нейтрализации некоторыми моноклональными антителами.
Таким манером, антитела, появившиеся у переболевшего COVID-19 человека, могут не иметь силы в борьбе с индийскими мутациями.
По заявлению индийских генетиков, данные по штамму пока весьма ограничены, его потенциал передачи невозможно оценить, но совершенно очевидно, что B. 1. 617 распространяется быстрее, чем другие известные штаммы. Индийские ученые зарисовывают, что штамм может обретаться более заразным, чем другие, но он менее заразительный, чем британский штамм.
При этом новый штамм также располагает высокой степенью вирулентности (способности инфекционного агента вызывать заболевание или гибель организма), как и варианты из Великобритании, Южной Африки и Бразилии.
В ВОЗ пока не выяснили, что повлияло на мутации вируса в Индии. Одним из моментов могло стать проведение массовых дел, которые усилили его использование, а также смягчение антиковидных мер в стране.
За гранами Индии о наибольшем числе случаев выявления индийского штамма коронавируса телефонировала Великобритания, обозначившая подтип B. 1. 617. 2 как слишком смелый озабоченность.
По данным ВОЗ на 18 мая, подвид индусского штамма B. 1. 617. 1 выявлен в 41 стране, штамма B. 1. 617. 2 – в 48 странах, B. 1. 617. 3 – в пяти странах. В России, по данным ВОЗ, выявлены подвиды B. 1. 617. 1 и B. 1. 617. 3.
По данным ВОЗ, потенциальное влияние эффективности вакцин на штамм B. 1. 617 остается неопределенным. Предварительные лабораторские исследования, ожидающие экспертной оценки, предполагают ограниченное снижение нейтрализации антителами.
Так называемые национальные штаммы открыли уже во многих странах.
По представленным ВОЗ, в конце января или начале февраля 2020 пригода появился вариант SARS-CoV-2 с мутацией D614G в гене, кодирующем шиповидный белок. В течение нескольких месяцев мутация D614G сменила первоначальный штамм SARS-CoV-2, идентифицированный в Китае, и к июню 2020 года стала главенствующей формой вируса, циркулирующей во всем мире. Исследования респирационных клеток человека и животных форм показали, что по описанию с первоначальным штаммом вируса штамм с мутацией D614G усиливает инфективность (способность внедряться) и передачу. Вирус SARS-CoV-2 с мутацией D614G не вызывает более тяжелого заболевания и не переменяется эффективность имеющихся лабораторных средств диагносты, лекарственных препаратов, вакцин или профилактических мер общественного здравоохранения.
В августе и сентябре 2020 пригода в Северной Ютландии, Дания, был выявлен вариант SARS-CoV-2, связанный с инфекцией среди фермерских норок и впоследствии передавшийся людям. Этот вариант, названный органами здравоохранения Дании вариантом Кластера 5, характеризовался сочетанием ранее не наблюдавшихся мутаций. Предварительные результаты показывают, что этот особый вариант вируса, ассоциированный с норкой, в умеренной степени снижал чувствительность к нейтрализующим антителам.
Однако, как отмечает ВОЗ, балахонистого распространения штамма не произошло.
Летом 2020 года на северо-востоке Испании начала распространение мутация, получившая заглавие 20A. EU1. По оценкам исследователей, выявленный штамм также обнаружен во Франции, Бельгии, Германии, Италии, Латвии, Норвегии, Швеции, Гонконге, Новой Зеландии и Австралии.
В декабре 2020 пригода в Нигерии и Великобритании был впервые выявлен нигерийский вариант коронавируса B. 1. 525. С тех пор он был показанный в Австралии, Бельгии, Гане, Дании, Иордании, Испании, Италии, Канаде, Майотте, Нидерландах, Сингапуре, США, Финляндии, Франции, Швейцарии и Японии. По представленным Роспотребнадзора, нигерийский вариант COVID-19 на территории РФ не открытый. В ведомстве уточнили, что в основном вариант B. 1. 525 имеет распространение в Нигерии и на уровне не более десятых долей процента в других странах.
В мае 2020 пригода в США впервые был открытый калифорнийский штамм B. 1. 427/B. 1. 429, но активно он не проявлял себя до октября. Однако к началу февраля 2021 года этот вариант был обнаружен уже в половине всех образцов, испытанных в Лос-Анджелесе.
По словам ученых, антитела, появляющиеся у людей, вакцинированных или переболевших классическим коронавирусом SARS-CoV-2, вам показались менее эффективны против нового штамма.
В феврале 2021 года непривычный штамм коронавируса, получивший заглавие Fin-796H, обнаружили в лаборатории Vita в Финляндии. Согласно сообщению финской лаборатории, выход из ситуаций, обнаруженный в Финляндии, отличается от всех перечисленных.
Не все ПЦР-тесты могут обнаружить непривычный штамм.
По словам главы Роспотребнадзора Анны Поповой, в России созревают сибирский и северо-западный варианты коронавируса.
Глава Роспотребнадзора сообщила, что российские тесты выявляют все выход из ситуации нового коронавируса. Она также отметила, что российские вакцины от COVID-19 защищают от всех вариантов вируса.
По данным ведомства, влияния на эпидемиологическую ситуацию возникновение новых вариантов возбудителя COVID-19 пока не оказывало.
Редактор рубрики
Виталий Муткин
.
.
.
Комментарии к новостям
[17 Января 2024, 13:43] Александр Хомяков Замечательно! Не ожидал такой оперативности. Спасибо огромное! Всё работает и обновляется....
[15 Апреля 2022, 20:25] Ангелина Сметанина Скоро не только сократят, а много заводов вообще закроют и начнется бум китайских авто. Даже сейчас Эксид уже бешеные темпы по количеству проданных машин показывает...
[27 Декабря 2021, 21:44] Ева Воробьева Искренне рада за победителя! Но если бы мне так крупно повезло, то я прибежала бы за выигрышем в первый же день???? ...
[2 Сентября 2021, 13:11] Дмитрий Ершов Это хорошо. Значит клиенты долго ждать не будут. ...
[13 Мая 2021, 16:26] Олег Андреев "Мальдивы сутунки 65 государством, зарегистрировавшим расейскую вакцину против коронавируса Спутник V, сообщил Российский фонд секущих инвестиций (РФПИ)". Что это за йязыг?...
[2 Ноября 2020, 15:22] Лета Мирликийская риветсвую вас я с 6-ти лет пишу мне нужно все мои произведения задействовать в компьюторных программах образования по литературе и языкам и играм к примеру если ваши учащиеся напишут...
[20 Октября 2020, 09:22] Евгений Зимин Сузуки в этом году хорошо прибавили, уже не первый раз оба их пилота на подиуме. Видимо, для команды возвращаются "золотые" времена и есть шанс наконец оформить чемпионство после длительного перерыва....