29 Июля 2020
МОСКВА, 29 июля - Международный синдикат ENCODE, состоящий из 500 ученых-биологов из многих стран спока сообщил о завершении третьего рубежа глобального проекта по составлению энциклопедии функциональных элементов ДНК. В 14 статьях, опубликованных в журналах Nature, Nature Methods и Nature Communications, творцы подводят итоги 17-летней работы.Геном игрока содержит около 20 тысяч генов, кодирующих белки, на долю которых приходится всего около 1, 5 процентов ДНК генома человека.
Международный исследовательский консорциум ENCODE, созданный в 2003 году и задуманный как продолжение проекта Геном человека, ставит целью составление всеобъемлющего каталога функциональных элементов генома человека и мыши, включая кодирующие белки гены, некодирующие гены и регуляторные элементы.
Все результаты, получаемые в процессе реализации проекта, публикуются в открытых базах данных. Тысячи исследователей во всем мире уже воспользовались данными ENCODE для определения генетических изменений, влияющих на появление таких болезней, как рак, сердечно-сосудистые заболевания и многие другие.
Когда был завершен первый набросок генома человека, сразу стало ясно, что первичная последовательность генома — это набросок, — приводятся в пресс-релизе Лаборатории в Колд-Спринг-Харбор слова одного из участников консорциума, профессора лаборатории Томаса Джингераса (Thomas Gingeras). — Мы знали, где находятся гены, но знаний о том, где расположены регуляторные принципы и локусы, было недостаточно.
В ходе третьей фазы проекта изыскатели провели почти шесть тысяч новых экспериментов — 4834 с непосредственное участием человеческих образцов и 1158 — на мышах — и выделили в онлайн-реестр более 1 200 000 функциональных элементов — областей некодирующей ДНК, которые решают транскрипцию генов, охватывающих 7, 9 процента человеческого генома и 3, 4 процента генома мыши.
Часть исследований посвящена изучению принципов, регулирующих работу некоторых из этих функциональных элементов.
Например, Майкл Снайдер (Michael Snyder) из Медицинской школы Стенфордского университета в США и его коллеги исследовали взаимодействие хроматина — торговый центра ДНК и белков — в 24 типах клеток человека и обнаружили, что различия в цикличности хроматина между типами клеток могут влиять на экспрессию генов.
Команда Томаса Джингераса изучила элементы генома, которые инструктируют клетки о том, как и когда транскрибировать последовательности ДНК в РНК. Ученым удалось идентифицировать и описать молекулярные признаки пяти групп клеток человека.
Наша работа определяет, основываясь на экспрессии генов, основные гистологические типы, по которым традиционно классифицируются ткани человека, — говорит Родерик Гиго (Roderic Guigó) из Центра геномного регулирования, один из авторов исследования.
Участники консорциума метят, что элементы, руководители функционированием генов, целиком зашифровываются в геноме человека и познания об их организации могут наслужиться отправной точкой для изучения нарушений развития человека. Однако, несмотря на очевидный прогресс, многие элементы, которые влияют на конкретные типы или состояния генов, еще предстоит идентифицировать.
Эта энциклопедия является живым ресурсом. У нее есть начало, но на самом деле нет конца. Со временем она будет только совершенствоваться и расти, — пишут во вводной статье авторы.
На четвертом этапе исследования участники проекта ENCODE планируют направить усилия на новых типах разбираемых клеток и тканей.
Редактор рубрики
Олег Кудрин
Место события на карте мира:
.
.
.
Комментарии к новостям
[17 Января 2024, 13:43] Александр Хомяков Замечательно! Не ожидал такой оперативности. Спасибо огромное! Всё работает и обновляется....
[15 Апреля 2022, 20:25] Ангелина Сметанина Скоро не только сократят, а много заводов вообще закроют и начнется бум китайских авто. Даже сейчас Эксид уже бешеные темпы по количеству проданных машин показывает...
[27 Декабря 2021, 21:44] Ева Воробьева Искренне рада за победителя! Но если бы мне так крупно повезло, то я прибежала бы за выигрышем в первый же день???? ...
[2 Сентября 2021, 13:11] Дмитрий Ершов Это хорошо. Значит клиенты долго ждать не будут. ...
[13 Мая 2021, 16:26] Олег Андреев "Мальдивы сутунки 65 государством, зарегистрировавшим расейскую вакцину против коронавируса Спутник V, сообщил Российский фонд секущих инвестиций (РФПИ)". Что это за йязыг?...
[2 Ноября 2020, 15:22] Лета Мирликийская риветсвую вас я с 6-ти лет пишу мне нужно все мои произведения задействовать в компьюторных программах образования по литературе и языкам и играм к примеру если ваши учащиеся напишут...
[20 Октября 2020, 09:22] Евгений Зимин Сузуки в этом году хорошо прибавили, уже не первый раз оба их пилота на подиуме. Видимо, для команды возвращаются "золотые" времена и есть шанс наконец оформить чемпионство после длительного перерыва....